gromacs شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با استفاده از نرم‌افزار
دسته: دسته‌بندی نشده
شنبه ۱۸ شهریور ۱۳۹۱
Molecular Dynamic Simulation using Gromacs Software[دوره آموزشی]
تهران - دانشگاه صنعتی مالک اشتر - پژوهشکده فناوری زیستی
برگزارکننده: دانشگاه صنعتی مالک اشتر
تاریخ شروع: شنبه ۱۸ شهریور ۱۳۹۱ - تاریخ پایان: دوشنبه ۲۰ شهریور ۱۳۹۱
تلفن تماس با دبیرخانه: 22970165
نمابر: 22974505
آدرس وب سایت:
آدرس ایمیل: biotech@mut.ac.ir
آموزش مباحث تئوری و شبیه سازی مولکولی
آموزش عملی نصب و استفاده از سیستم عامل لینوکس ونرم افزار GROMACS
تمرین عملی شبیه سازی مولکولی با استفاده از نرم افزار GROMACS
کارگاه آموزشی «شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با استفاده از نرم‌افزار گرومکس ، هجدهم تا بيستم شهريور ماه سال جاري توسط پژوهشکده فناوری زیستی دانشگاه مالک اشتر برگزار می‌شود.امروزه شبیه‌سازي کامپیوتري ابزار جديدي براي حل مشکلات علمي و نیز مکمل روشهای آزمایشگاهی به کار می‌رود. يکي از اهداف بسیار مهم شبیه سازهاي کامپیوتري، شبیه‌سازي شرايط آزمايش به منظور آشکار ساختن مکانیزم مولکولي در ابعاد میکروسکوپی مي‌باشد. شبیه‌سازی می‌تواند جزئی‌ترین اطلاعات را پیرامون جنبش ذرات به عنوان تابعی از زمان فراهم کند. به همین جهت بعنوان ابزاری توانمند در بسیاری از رشته‌های علوم، زیست‌شناسی، شیمی، فیزیک، مهندسی، علوم فضایی، پزشکی، داروسازی و … کاربردهای فراوانی دارد. به عنوان مثال با استفاده از روشهای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی می‌توان خواص پروتئین‌ها و اسیدهای نوکلئیک را بررسی کرد، مکانیسم عمل آنزیم‌ها را شناسایی کرد و در طراحی داروها از این روش‌ها بهره برد
.در یک تعریف کلی شاید بتوان گفت شبیه‌سازی تقلیدی از عملکرد سیستم واقعی با گذشت زمان است. بنابراین می‌توان از آن برای پاسخ دادن به سوالاتی راجع به یک سیستم مدل استفاده کرد و این کار بسیار آسانتر از انجام آزمایش بر روی یک سیستم حقیقی است
در این راستا نرم‌افزارهای شبیه‌سازی بسیاری با کاربردهای گوناگون ارائه شده است. از آن جمله می‌توان به نرم‌افزارهای امبر ، چارم، نمد، گرومکس و … اشاره کرد. که در بین آنها استفاده از نرم افزار گرومکس به علت سادگی، در دسترس بودن و پیشرفت روز افزون آن از گستردگی بیشتری برخوردار است. بنابراین در گارکاه حاضر از نرم‌افزار گرومکس به منظور شبیه‌سازی دینامیک مولکولی استفاده خواهد شد.
.در یک تعریف کلی شاید بتوان گفت شبیه‌سازی تقلیدی از عملکرد سیستم واقعی با گذشت زمان است. بنابراین می‌توان از آن برای پاسخ دادن به سوالاتی راجع به یک سیستم مدل استفاده کرد و این کار بسیار آسانتر از انجام آزمایش بر روی یک سیستم حقیقی است
در این راستا نرم‌افزارهای شبیه‌سازی بسیاری با کاربردهای گوناگون ارائه شده است. از آن جمله می‌توان به نرم‌افزارهای امبر ، چارم، نمد، گرومکس و … اشاره کرد. که در بین آنها استفاده از نرم افزار گرومکس به علت سادگی، در دسترس بودن و پیشرفت روز افزون آن از گستردگی بیشتری برخوردار است. بنابراین در گارکاه حاضر از نرم‌افزار گرومکس به منظور شبیه‌سازی دینامیک مولکولی استفاده خواهد شد.
مسئول یا دبیر همایش: سرکار خانم منصوره سیدکریمی
امکان ارسال مقاله: بله
بازدید: 1532